工程结算审计的主要内容包括以下几个方面：
工程形象进度的工程量
施工产值和预算成本的正确性、真实性
本期应结工程价款净值与本期实际完成的施工产值或结算价值的匹配性
预收工程款、抵扣备料款、甲方材料款及其他应扣款的扣除情况
竣工质量验收和竣工决算的合规性
未完部分尾工预提费用的合理性
双方经济往来是否清楚，有无违反结算纪律行为
工程竣工报告、竣工图及竣工验收单
工程施工合同或施工协议书
施工图预算或招标投标工程的合同标价
设计交底及图纸会审记录资料
设计变更通知单及现场施工变更记录
经建设单位签证认可的施工技术组织措施
预算外各种施工签证或施工记录
合同中规定的定额、材料预算价格、构件、成品价格
国家或地区新颁发的有关规定
核定施工工程量
重点审核投资比例较大的分项工程，如基础工程、混凝土钢筋混凝土工程、钢结构等
重点审核容易混淆或出漏洞的项目
材料用量及价差
隐蔽验收记录
工程定额的套用
工程类别
各项费用的计取
附属工程
防止各种计算误差
严格审核施工企业的资质
